بخش جدید کشکسرای بنا به پیشنهاد وزارت کشور و تصویب‌نامه هیأت دولت به تاریخ 1399/10/13 و به استناد ماده ۱۳ قانون تعاریف و ضوابط تقسیمات کشوری ایجاد شده است.

این بخش از ترکیب دهستان‌های یالقوزآغاج و کشکسرای و شهر کشکسرای به عنوان مرکز بخش ایجاد شده و سومین بخش شهرستان مرند به شمار می‌رود.

در مراسم افتتاح بخشداری کشکسرای، حسین غفاری با حکم استاندار آذربایجان شرقی به عنوان نخستین بخشدار این بخش معرفی شد.